בבניין המרכזי שבאוניברסיטת חיפה חבוי מוזיאון המציג פריטים ארכיאולוגיים, המייצגים את התרבות החומרית בתקופותיה הקדומות של ארץ ישראל.
שני אוספים עיקריים בו: אוסף מטבעות יהודיים ואוסף החותמות הכתובים מתקופת המקרא – מהגדולים והחשובים בתחום. במוזיאון תערוכת קבע המתמקדת בתרומתם של הפניקים לאדריכלות ולבניית נמלים, ותערוכה המתמקדת בשבע מלאכות ותעשיות קדומות. אטרקציה מיוחדת היא ספינה בת 2,400 שנה שנמצאה במעגן מיכאל. באגף לאמנות מוצגות עבודות מזרמי אמנות שונים החל מאמצע המאה ה- 17 , בדגש על האימפרסיוניזם ועל עבודות אמנים יהודים מהאסכולה של פריז.